Mahasiswa UNNES jenjang Magister/Doktor tahun masuk 2023 dan setelahnya diwajibkan membayar Biaya Pendidikan Tunggal (BPT) yang besarnya sama tiap semesternya.
| Jenis Layanan | Satuan | Tarif | |
| I. Program Magister | |||
| Pendaftaran | Per Orang | 350.000 | |
| Biaya Pendidikan Tunggal (BPT) | |||
| a. Kelas Reguler | Mhs/Semester | 7.500.000 | |
| b. Mahasiswa Asing | Mhs/Semester | 12.500.000 | |
| c. Kelas Kerjasama | Mhs/Semester | 12.500.000 | |
| d. Rekognisi Pembelajaran Lampau (RPL) | Mhs/Semester | 10.000.000 | |
| e. By Research | Mhs/ Semester | 10.500.000 | |
| f. Fast Track | Mhs/ Semester | 3.500.000 | |
| II. Program Doktor | |||
| Pendaftaran | Per Orang | 750.000 | |
| Biaya Pendidikan Tunggal (BPT) | |||
| a. Kelas Reguler | Mhs/Semester | 10.000.000 | |
| b. Mahasiswa Asing | Mhs/ Semester | 15.000.000 | |
| c. Kelas Kerjasama | Mhs/Sernester | 13.000.000 | |
| d. By Research | Mhs/ Semester | 12.500.000 | |
| e. Rekognisi Pembelajaran Lampau (RPL) | Mhs/ Semester | 12.500.000 | |
